Война застала Николая Митрофановича в его родном городе Воронеж. В 1943 году был мобилизован в Красную Армию. Службу начал в 736-ом зенитно-артиллерийском полку в должности наводчика зенитного орудия.С боями прошел Воронежский и 1-ый Украинский фронты, воевал в Южной группе войск. Охраняли железную дорогу, железнодорожные мосты и вокзалы. На счету их полка - 69 сбитых самолетов противника. День победы сержант Бавыкин встретил в Румынии в городе Плоешти. К тому времени он уже был командиром зенитной установки и старшиной батареи.

Награжден орденами и медалями Великой Отечественной войны. Особенно дороги ему были боевые награды "За отвагу" и "За боевые заслуги". Служба в 736-ом зенитном полку закончилась в 1950 году.

После войны Николай Митрофанович работал инструктором по тяжелой атлетике в спортивном обществе "Динамо", затем учителем физкультуры школы п. Мичуринский Новосибирского района.