Василий Юлианович Болтрукевич в июле 1941 года вступил добровольцем в 4 дивизию народного ополчения города Москвы.В составе дивизии участвовал в строительстве Ржевско-Вяземского оборонительного рубежа. В частности создавал укрепления в районах станций Новодугино, Сычёвка, Андреевское Смоленской области, которые стали опорными пунктами сопротивления советских войск. Далее участвовал в обороне восточного берега озера Селигер. 26 сентября 4-я дивизия народного ополчения была переименована в 110-ю стрелковую дивизию. Василий Юлианович в составе 1287 полка 110 стрелковой дивизии оборонял Наро-Фоминск.

В январе-феврале 1942 года Василий Юлианович Болтрукевич принимал участие в Ржевско-Вяземской стратегической наступательной операции, одной из самых кровопролитных операций Великой Отечественной войны. В этих боях 22 февраля 1942 года при освобождении деревни Ивищи Износковского района Василий Юлианович получил тяжёлое ранение позвоночника. Врачи предрекали ему лежачую жизнь до конца его дней. Но он, благодаря своей силы воли, вышел из госпиталя на своих ногах. До конца своих дней он делал специальную зарядку, а в его кабинете в Госплане РСФСР была специальная конторка за которой он работал стоя.