В 1940г. окончил 9 классов школы.

С сентября 1940г. курсант Кировобадской военной авиационной школы пилотов.

25 сентября 1941г. присвоено звание сержант. Назначен пилотом в 41 скоростной бомбардировочный авиаполк (г.Ереван).

Осенью 1942г. направлен в 99 бомбардировочный авиаполк. Командира полка майор Якобсон Александр Юрьевич.

К декабрю 1942г. полк перебазировался на аэродром Алтухов.

С 13 декабря вел боевую работу по уничтожению окруженной под Сталинградом группировки Паулюса.

30 января 1943г. экипаж самолета Пе-2: летчик сержант Брагин Николай Дмитриевич, штурман младший лейтенант Краснощек Василий Федорович, воздушный стрелок-радист старший сержант Бойков Александр Ильич- бомбардировал позиции противника на территории поселка Сталинградского тракторного завода. На обратном маршруте у самолета перегорел блок левого мотора. Летчик, чтобы не сжечь мотор, отключил его за 30км. до аэродрома. Благополучно приземлился на правом моторе.

С начала февраля по 05 мая 1943г. полк боевой работы не вел.

Вошел в состав 301 бомбардировочной авиадивизии.

05 мая экипаж Брагин, Краснощек, Бойков в составе пятерки бомбардировал склады с горючим и боеприпасами в пос.Локоть.

07 мая в составе восьмерки- войска противника у хут.Михайловский.

80 мая, вылетев на задание, два экипажа, среди которых был экипаж Брагина, отстали от группы. Не догнав группу до линии фронта, экипажи вернулись на свой аэродром.

Старший сержант Брагин совершил 8 боевых вылетов. Приказом от 02 июня 1945г. был награжден орденом Красной Звезды.

27 мая 1943г. присвоено звание младший лейтенант.

17 июня 1943г. полк был преобразован в 96 гвардейский бомбардировочный авиаполк.

Участвовал в Курской битве и Севско-Гомельской операции.

10 июля экипаж Брагин, Краснощек, Бойков участвовал в бомбардировке войск противника в районе Сабуровка.

С 21 сентября полк действовал с аэродрома Слоут.

В этот день экипаж самолета №18/236: гвардии младший лейтенант Брагин, гвардии младший лейтенант Краснощек, стрелок-радист гвардии старший сержант Афремов Вячеслав Юрьевич- в составе девятки Пе-2 бомбардировал железнодорожную станцию Новозыбков. На обратном маршруте из-за дымки над своим аэродромом экипаж произвел посадку на аэродром Глухов.

К 15 октября 1943г. полк перебазировался на аэродром Санковичи (Белорусский, впоследствии, 1 Белорусский фронт). Поддерживал действия наших наземных частей в Речицком районе Гомельской области.

В начале 1944г. полк, базируясь на аэродроме Зябровка, наносил удары по войскам противника в районах Калинковичи, Мозырь, Рогачев, Жлобин.

К концу января командир звена Брагин совершил 40 боевых вылетов. Был представлен к ордену Красного Знамени, приказ о награждении от 13 марта 1944г.

18 февраля 1944г. присвоено звание лейтенант.

В 1944г. принят в ряды ВКП(б), партбилет №6807579.

Летом 1944г. полк участвовал в Бобруйской операции. Бомбардировочными ударами способствовал прорыву обороны противника. Затем, были разрушены мосты и переправы на Березине и отрезаны пути отхода жлобинской группировке. К исходу 27 июня бомбардировали окруженную группировку юго-восточнее Бобруйска. После этого, полк уничтожал войска противника, отходившие из Бобруйска.

С августа 1944г. полк боевой работы не вел, находился в резерве на аэродроме Кобрин.

С января 1945г. полк участвовал в операциях по освобождению Польши, в феврале бомбардировал сооружения крепости «Цитадела» в Познани, уничтожал восточно-померанскую группировку противника.

07 февраля Николай Дмитриевич был направлен в лазарет (причина не указана).

17 февраля полк группами по 2-3 самолета и одиночными экипажами без прикрытия истребителей бомбардировал сооружения крепости «Цитадела» в Познани. Над целью прямым попаданием зенитного снаряда был сбит экипаж самолета №4/325: командир звена гвардии лейтенант Брагин Николай Дмитриевич, штурман гвардии младший лейтенант Лукьяненко Борис Тимофеевич, стрелок-радист гвардии старшина Солонин Иван Васильевич, моторист сержант Самарин Сергей Федорович. Самолет сгорел, экипаж погиб.

Экипаж был похоронен на площади Помятовского в г.Познань, Польша.