Родился в 1917 году в Баку.

В 1940 году окончил кафедру зоологии и сравнительной анатомии позвоночных животных МГУ. С 1940 года работал в лаборатории экологии Московского зоопарка.

Воевал в качестве зоолога санитарно-эпидемиологической лаборатории Воронежского фронта. Войну закончил лейтенантом медицинской службы. Награжден орденом Красной Звезды, медалью «За боевые заслуги».

В 1945 году демобилизован, вернулся в Москву и работал в террариуме зоопарка. В 50-х гг. работал в Институте физиологии, старшим научным сотрудником в лаборатории биологии развития животных на биологическом факультете МГУ. В 1966-67 гг.- старшим научным сотрудником отдела сравнительной анатомии музея. Первые работы В.В. Черномордикова были посвящены различным вопросам экологии пресмыкающихся, позднее перешел к изучению экофизиологии, преимущественно млекопитающих. В 1951 году защитил кандидатскую диссертацию, в 1965 году – докторскую.