Вероятно, к началу войны служил в 1-й Высшей школе штурманов ВВС Красной Армии (г.Рязань).

В июле 1941г. на базе школы был сформирован 1 дальний разведывательный авиационный полк (командир полка подполковник Сабуров Михаил Дмитриевич).

С 20 июля по 10 сентября 1941г. полк выполнял задания на Северо-Западном, Западном, Юго-Западном и Брянском фронтах, ведя боевую работу с аэродромов подскока.

Экипаж: летчик старший лейтенант Суворов Иван Васильевич,- штурман старший лейтенант Рязанцев Григорий Тихонович, воздушный стрелок-радист младший сержант Гордиенко Иван Сидорович. успешно выполнял боевые задания, доставляя ценные сведения о противнике.

Иван Сидорович был награжден медалями «За оборону Москвы», «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг.».

После войны продолжил службу. 

В 1953г. за долголетнюю и безупречную службу старшина Гордиенко был награжден медалью «За боевые заслуги».

В честь 40-летия Победы награжден орденом Отечественной войны II степени.