Родился 30 Декабря 1926 года в д. Еремеево Чишминского района БАССР. Является сыном народного сэсэна республики Саита Исмагилова. Закир рос и воспитывался под его позитивным влиянием, с самого детства любил народные песни и танцы, впитывал в себя лучшие образцы устного творчества, хорошо понимал национальные традиции и обычаи. Играл на курае, самодельной скрипке, многих музыкальных инструментах. Уже в юности Закир получил известность как талантливый исполнитель народных танцев. Участвовал в сельских и районных сабантуях.

После окончания семилетней школы Закир Исмагилов работал в местном колхозе. Перед самой войной он поступил в Башкирское театрально-художественное училище, где учился по классу танца у выдающегося ленинградского хореографа Карла Матсона, находящегося в Уфе в ссылке. Педантичный и строгий преподаватель научил молодого человека всем азам танцевального искусства.

З. С. Исмагилов - участник Великой Отечественной войны. После окончания Башкирского театрально-художественного училища (1942; педагог К.В. Матсон) до 1943 артист Башкирской филармонии, с 1948 — Ансамбля песни и пляски Сов. Армии им. А.В.Александрова (Москва), с 1951 солист и педагог-репетитор Башкирского государственного ансамбля нар. танца (см. Ансамбль народного танца им. Ф. Гаскарова), в 1961 — 1987 режиссёр Государственного комитета БАССР по ТВ и радиовещанию. Сольные партии в танцах: «Бесәнселәр» («Косари»), «Гопак», «Жених», «Өс туған» («Три брата») и др. В разные годы руководил самодеятельными танцевальными коллективами республики. Режиссёр одного из первых черно-белых телевизионных фильмов «Кто пел?» (1969), цикла телепередач «Жемчужины народного творчества» (1970—1985). Участник Декады башкирской литературы и искусства в Москве (1955). Снимался в фильме-балете «Журавлиная песнь» (Свердловская к/ст, 1959). Лауреат Всероссийского конкурса артистов эстрады (Москва, 1960). Награждён орд. «Знак Почёта» (1971).

Жена — Роза Мутагаровна, также является актёром русского драматического театра, в семье есть четыре сына — Рим, Галей, Рустем и Тагир, а также внуки — Эльмар, Адиль, Эмиль, Милина, Адель и другие.