К началу войны  был председателем преуспеваюзщего колхоза имени Шевченко, расположенного на землях хутора Желтые копани Краснодарского края. От "брони" руководителя Семен Владимирович отказался, и 12 сентября 1941 г. ушел на фронт. Мобилизован в 183-й кавалерийский полк. Из Тихорецка полк переброшен на защиту Ростова-на-Дону, где шли ожесточеные бои - советские солдаты стояли насмерть, чтобы не пропустиить врага к Азовскому морю. Семен Костенко погиб в сражении за освобождение хутора Калинин Ростовской области 27 ноября 1941 г. Похоронен в селе Сафьяново Мясниковского р-на Ростовской области.