Летом 1941 г призван на Западный фронт. 14 марта 1943 г во время освобождения Смоленщины от фашистов, получил ранение под Спас-Деменском, лечился в госпитале. После выздоровления был направлен на офицерские курсы, а далее на фронт командиром саперного взвода. Воевал под Сталининградом, Донецком, освобождал Севастополь. 

С 24 августа 1943 г по 10.06.1945 г сражался на Прибалтийском фронте.  5 октября 1944 г выполнял задание по постройке моста через р.Дубисса у селения Режали (Литовская ССР), противник держал место наводки моста под огнем, но гв.млад.лейтенант Козлов со взводом, отражая огонь, выполнил задание в срок, уложив прогоны и настил. По мосту переправились наступающие подразделения с техникой. Представлен к награде Орден "Красной Звезды".

19 февраля 1945 г в районе 3 км Северо-Западнее г Гольтарбен (Замланский п-ов) т.Козлов минировал передний край. Противник перешел в атаку пехотой и танками. Мл.лейтенант Козлов со взводом саперов принял бой и отбил 4 контратаки, прочно удержав рубеж. В этом бою Козлов был ранен и направлен на лечение.  Предствлен к награде Орден "Отечественной войны 1 степени"