Сергей Тимофеевич был призван в армию осенью 1941 года. После прохождения переподготовки в г. Юрга и г. Кемерово был направлен на Ленинградский фронт в состав в 1912 стрелкового полка автоматной роты в должности старшины. В последствии, указанный полк был отнесен к выделившемуся Воловскому фронту.

Сохранился билет истребителя, в котором отмечены  заслуги Сергея Тимофеевича, а также необычный факт - сбитие немецкого самолета “Фоккер-Вульф” выстрелом из винтовки. Так же в семье сохранилась пожелтевшая газетная вырезка со статьей “Снайперы-истребители-грозная сила”, в которой упоминаются заслуги старшины Мальцева. Рассматривая данные документы, можно сделать вывод о тяжелых боях лета 1942 года на Волховском фронте. Это подтверждают и награды Сергея Тимофеевича этого периода - орден “Красное Знамя”  и медаль "За Отвагу ". 

10 августа 1942 года Сергей Тимофеевич был тяжело ранен разрывной пулей в левый коленный сустав. В эвакуационных госпиталях сделали первую операцию. В последствии в г. Киров была проведена повторная операция. К сожалению, подвижность ноги восстановить не получилось. Врачебной комиссией принято решение о комиссовании и отправке домой в г. Новосибирск. И в феврале 1943 г. вернулся к семье. 19 августа 1943 г. присвоено звание лейтенанта, что подтверждается справкой, выданной на повторный запрос в госпиталь, где он проходил лечение.

Летом 1945 г. простыл и серьезно заболел воспалением легких. 26 сентября 1945 г. Сергея Тимофеевича не стало.