В 1939 году поступил в Саратовский аэроклуб, который окончил в ноябре 1939 года. В апреле 1940 года добровольно пошёл в Красную армию и был принят курсантом в Саратовскую и далее Тоцкую военную авиационную школу пилотов, которую окончил в июле 1941г. По окончании был назначен лётчиком-инструктором в 16-ю военно-авиационную школу лётчиков. 

Начало Великой Отечественной войны 22 июня 1941 года ускорило ход жизни, изменило её. Подавая рапорты командованию о направлении в действующую армию. В октябре 1941 году Маркина В.И. перевели в 634-й Ночной бомбардировочный авиаполк лётчиком и направили на фронт. Участвовал в боях за Москву на Западном фронте. Летая днём и ночью на боевые задания, выполнял спецзадания командования. До мая 1943 года летал преимущественно ночью, часто получая задания на разведку, сначала в 634-м, а затем в 615-м авиаполках и 337-й отдельной разведывательной авиаэскадрильи фронта. В мае 1943 года перешёл в 10-й Московский отдельный разведывательный авиаполк, где выполнял боевые задания на разведку на самолётах ИЛ-2. В июле 1943 года в бою над Брянском был ранен, дважды (в 1943г. и в 1944г.) сильно контужен. Лечился в фронтовых госпиталях. Войну закончил 9 мая 1945 года под г. Данциг.