В 1939 году С.Т.Непшекуев был призван в ряды Красной Армии. Участвовал в советско-финляндской войне, был защитником Родины от начала до конца Великой Отечественной войны. Активное участие принимал в освобождении Прибалтики, Белоруссии, Польши, окончил войну в Потсдаме. 

Сагид Тагирович прошел путь от рядового красноармейца до командира стрелкового взвода. Из Красной Армии демобилизовался по состоянию здоровья (трижды был ранен). 

За мужество, храбрость, героизм, проявленные в годы войны, за образцовое выполнение боевых заданий Сагид Тагирович был удостоен ордена Красной Звезды, медалей «За оборону Кавказа», «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941—1945 гг.», «За взятие Берлина», «За освобождение Варшавы». 
Сагид Тагирович не любил разговоры о войне, избегал их, наверное, как и многие прошедшие этот страшный путь. Остались сухие факты его побед. Семья никогда не забудет подвиг героя!