С декабря 1939г. курсант  военного авиационного училища летнабов и штурманов (вероятно, Харьковского).

23 января 1940г. принял военную присягу.

28 ноября 1940г., по окончанию училища, присвоено звание младший лейтенант. 

Служил в составе 41 скоростного бомбардировочного авиаполка Закавказского военного округа.

К августу 1945г. штурман звена 56 бомбардировочного авиаполка.

Полк участвовал в Советско-японской войне.

Дмитрий Дмитриевич совершил боевой вылет на самолете Ил-4 в район Джаланьтунь- Цицикар, Тпонань.

В ночь с 12 на 13 августа, с вылета в район Цицикар- Ванемяо не возвратился экипаж: заместитель командира полка по политчасти майор Гаврилов Семен Николаевич, штурман звена лейтенант Никонков Дмитрий Дмитриевич, воздушный стрелок-радист сержант Карасев Семен Никонович.

28 августа 1945г. лейтенант Никонков был представлен к ордену Отечественной войны II степени, посмертно. Приказ о награждении от 28 августа 1945г.

Экипаж был похоронен на мемориале в г.Чанчунь, Китай (в списке захоронения- Никанков Дмитрий Дмитриевич).