Войну Сергей Рукояткин встретил в Ленинграде школьником. Вместе с родителями, старшими братьями и сестрой жил на Охте, Таллинская ул. д.4 (отцу, как стахановцу, дали комнату в коммуналке в новом доме незадолго до войны). Едва не умер от голода, в январе 1942 г. был эвакуирован по Дороге Жизни в Ярославскую область, 28 декабря 1942 г. РВК Палкинского р-на был призван в РККА и направлен в военное училище. Весной 1943 г. курсанты училища были направлены на фронт, Сергей Рукояткин был определён автоматчиком в пехотный полк. Трижды ранен (второй раз тяжелое осколочное ранение в лицо, инвалид войны). Награждён медалью "За отвагу". Закончил войну в Прибалтике, демобилизован 03.10.1945. После войны работал на ленинградских предприятиях.