В сорок первом Шкирев Ф.П. был призван на флот, но не попал, так как при проверке оказалось, что у него хороший слух, и направление в бумагах изменили на школу радиоспециалистов. Потом попал на север в 57 отдельный полк, обеспечивающий связью штаб Карельского фронта. Как наиболее знающий специалист он преподавал в учебной роте. Вместе с аэросанным батальоном выезжал на фотографирование линии обороны на Выг-озеро. Перед самым носом у фашистов передавал командованию сведения. Затем, когда линию обороны начали фотографировать с воздуха, Шкирев Ф.П. перекочевал в 6 отдельный батальон минеров. Этот батальон совершал диверсии в тылу врага, взрывал мосты, железнодорожные составы, громил вражеские гарнизоны. Шкирев Ф.П. принимал участие в качестве начальника радиостанции в рейдах в тыл врага.

Из северных операций Шкиреву Ф.П. запомнилось несколько. Первая: подрыв моста на Ухтинском направлении. Второй группе пришлось принимать участие в захвате "языка". Готовилась операция против финнов и командование сочло нужным направить группу. Много времени пришлось лежать бойцам, пока на дороге появилась фигура в военной форме. Это финн-почтальон спешил с корреспонденцией на позиции. Попасть к русским он, конечно, не рассчитывал.

Была и еще одна. В один из туманных дней с военного аэродрома поднялись тяжелые "дугласы" и взяли курс на Норвегию. Прыгать пришлось при ограниченной видимости. Светлые пятна парашютов один за другим ложились на чужие скалы. Закрепившись, группа приступила к выполнению задания. Обнаружив огневые точки противника, она сообщила об этом в центр. Сведения передавались закодированно, но те, кто их принимал, понимали, что эа этими беглыми сообщениямим стояло одно: "Вызываем огонь на себя". И огонь был. Был шквал огня, пережидая который, десантники вжимались в эти чужие скалы, а потом переходили на другое место, к новым позициям врага.

6-й отдельный батальон минеров бал гвардейским, более того, за успешное выполнение заданий командования его наградили орденом Красного Знамени.

После перемирия с Финляндией части с Севера переборосили в Европу. Шкирев Ф.П. принимал участие в разгроме танковой группы немцев юго-западнее Будапешта, когда нашим войскам противоборствовали одиннадцать танковых дивизий.

За участие в этих боях гвардии старший сержант Шкирев М.Ф. получил благодарность от Верховного главнокомандующего. Вторую благодарность он получил как участник боев за освобождение столицы Австрии - города  Вены.