В Красной Армии с августа 1936г.

Окончил военную авиационную школу.

В 1939г. принят в ряды ВКП(б).

Возможно, служил в составе 12 бомбардировочного авиаполка.

В начале августа 1941г. в Закавказье на базе полка были сформированы 12 «А» дальнебомбардировочный авиаполк (был переименован в 454) и 113 дальнебомбардировочная авиадивизия. 

В конце августа дивизия участвовала в Иранской операции. 

К декабрю 1941г. лейтенант Чернов в составе 454 дальнебомбардировочного авиаполка. Полк имел на вооружении самолеты ДБ-3ф. Базировался на аэродроме Крымская. Вел боевую работу на Крымском фронте.

22 декабря 1941г. пара 1 авиаэскадрильи полка в период с 10-20 до 14-15 совершила вылет на бомбардировку войск противника на дороге Ялта- Байдары. При возвращении, лейтенант Чернов произвел посадку на аэродром Тихорецкая. 

С февраля 1942г. командир звена старший лейтенант Чернов исполнял обязанности заместителя командира эскадрильи.

26 марта группа из 4 самолетов ДБ-3ф вылетела в 06-45 на бомбардировку позиций противника в районе Новомихайловки. Возвращаясь после выполнения боевого задания, четверка была атакована истребителями противника. Самолет Евгения Ивановича был подбит. Летчик сумел перетянуть на горящем самолете за линию фронта и произвел посадку на своей территории. Другие экипажи с задания не возвратились.  

К средине марта 1942г. совершил 16 успешных боевых вылетов. Был представлен к ордену Красного Знамени. Приказ о награждении от 08 июля 1942г.

В мае 1942г. полк был выведен в тыл на переформирование. В составе полка Евгений Иванович выполнил 24 боевых вылета.

Евгений Иванович был направлен в состав 37 бомбардировочного авиаполка. Личный состав полка находился на одном из подмосковных аэродромов и осваивал американские бомбардировщики В-25 «Митчелл».

С августа 1942г. полк действовал на Западном фронте. 

29 сентября был переименован в 37 авиаполк дальнего действия.

К началу 1943г. командир звена старший лейтенант Чернов в составе полка совершил 37 ночных боевых вылетов на бомбардировку железнодорожных узлов Витебск, Смоленск, Вязьма, Полоцк, Оленино; аэродромов Орел, Вязьма, Смоленск, Орша, Сеща; позиций противника в районах Великие Луки, Сычевка, Смоленск, Вязьма, Витебск и др.

Был представлен к ордену Ленина. Приказом от 12 марта 1943г. награжден вторым орденом Красного Знамени.

26 марта 1943г. полк был переименован в 13 гвардейский авиаполк дальнего действия.

В апреле-мае экипажи полка уничтожали военно-промышленный объекты противника на территории Польши и Восточной Пруссии.

В ночь с 28 на 29 апреля экипаж: капитан Чернов Евгений Иванович, второй пилот младший лейтенант Троценко Григорий Павлович, штурман звена капитан Попков Николай Алексеевич (воевал в составе 454 дальнебомбардировочного авиаполка), стрелок-радист старшина Секерин Алексей Степанович, воздушный стрелок сержант Хритинин Алексей Федорович- в 00-18 с высоты 4300м. сбросил 4 авиабомбы ФАБ-250 в районе железнодорожной станции Ратенштейн (Кенигсберг) Продолжительность вылета 7ч. 45 мин.

В ночь с 08 на 09 мая экипаж Чернов, Троценко, Попков, Секерин, Хритинин- в составе девятки вылетел на бомбардировку железнодорожного моста через Днепр в районе Киева. По радио группа была возвращена и благополучно приземлилась на свой аэродром с бомбами.

С июля 1943г. участвовали в Курской битве.

В ночь на 02 августа 15 бомбардировщиков уничтожали узлы сопротивления противника восточнее станции Мга (Ленинградская обл.).

Экипаж Евгения Ивановича первым в полку овладел техникой фотографирования ночью с больших высот.

К 08 августа 1943г. гвардии капитан Чернов совершил более 100 боевых вылетов. Был представлен к присвоению звания Герой Советского Союза. Командование дивизии представление не поддержало, представив Евгения Ивановича к ордену Ленина.

В ночь на 12 августа экипаж: заместитель командира эскадрильи гвардии капитан Чернов Евгений Иванович, второй пилот гвардии младший лейтенант Калинин Григорий Федорович, штурман гвардии младший лейтенант Поляков Василий Сергеевич, штурман-контролер гвардии старший лейтенант Цыбульник Алексей Никифорович, стрелок-радист гвардии старшина Шалаев Михаил Игнатьевич, старший воздушный стрелок гвардии старшина Белов Константин Александрович- в составе группы из 17 самолетов бомбардировал железнодорожный узел Полтава-Киевская.

В ночь на 15 августа 1943г. 2 самолета полка вылетели на спецзадание по выброске грузов и партизан в тыл противника на точке №60 (район г.Барановичи). Экипаж самолета В-25D №250: заместитель командира эскадрильи гвардии капитан Чернов Евгений Иванович, второй пилот гвардии младший лейтенант Калинин Григорий Федорович, штурман звена гвардии старший лейтенант Цыбульник Алексей Никифорович, стрелок-радист гвардии старшина Шалаев Михаил Игнатьевич, старший воздушный стрелок гвардии старшина Белов Константин Александрович- вез 4 агентов-партизан, инструктора парашютно-десантной службы и 5 мешков с военными грузами весом 650кг. В 21-55 с борта самолета была передана радиограмма о проходе линии фронта. Других радиограмм экипаж не давал, на запросы наземной радиостанции не отвечал. 

Экипаж был сбит истребителем противника в районе г.Рославль.  Евгений Иванович спасся на парашюте. Вышел к партизанам. 07 сентября 1943г. из отряда был переправлен на «большую землю» и вернулся в полк.

Вечером 20 октября группа из 15 самолетов полка вылетела на бомбардировку железнодорожного узла Фастов. Экипаж: командир корабля гвардии капитан Чернов, летчик- командир звена гвардии старший лейтенант Лазарев Иван Александрович (05 ноября 1944г. присвоено звание Герой Советского Союза), штурман эскадрильи гвардии капитан Петровский Михаил Семенович, стрелок-радист гвардии старшина Июдин Алексей Федорович, воздушный стрелок Возолин- в 20-00 с высоты 2400м. произвел подсветку цели.

03 ноября 1943г. был повторно представлен к ордену Ленина. Представление поддержали командование авиадивизии и авиакорпуса. Приказом от 29 декабря 1943г. гвардии майор Чернов был награжден орденом Отечественной войны I степени.

К концу марта 1944г. заместитель командира эскадрильи гвардии майор Чернов совершил 172 боевых вылета. Был представлен к ордену Красного Знамени, приказом от 28 апреля 1944г. награжден орденом Александра Невского.

26 декабря 1944г. полк был преобразован в 251 гвардейский бомбардировочный авиаполк.

В ночь с 19 на 20 апреля 1945г. экипаж: гвардии майор Чернов, летчик младший лейтенант Приходько Михаил Дмитриевич, штурман Федоров, стрелок-радист старшина Сиянко Василий Макарович, воздушные стрелки Галкин и Ропаковский – в составе дивизионной группы бомбардировал железнодорожный узел Зноима.

К 21 апреля 1945г. Евгений Иванович совершил 208 боевых вылетов. Приказом от 16 мая 1945г. был награжден третьи орденом Красного Знамени.

Награжден медалями «За оборону Ленинграда», «За взятие Будапешта», «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг.».

За долголетнюю и безупречную службу в 1946г. награжден медалью «За боевые заслуги», в 1951г.- орденом Красной Звезды, в 1955г.- четвертым орденом Красного Знамени.

Гвардии подполковник Чернов был уволен в запас 10 апреля 1959г.