С сентября 1941г. механик авиационный 511 скоростного бомбардировочного авиаполка (командир полка- майор Бабанов Анатолий Александрович).

Награжден медалью «За оборону Москвы».

С марта 1942г. по июнь 1943г. полк проходил переучивание по программе курса разведывательной авиации. Переименован в 511 отдельный разведывательный авиаполк.

В конце марта 1944г. командиром полка назначен подполковник Берман Семен Давидович.

05 августа 1944г. самолет летчика Костарева Михаила Васильевича из-за повреждений, полученных в воздушном бою, совершил вынужденную посадку в поле с убранными шасси. Павел Емельянович с группой механиков восстановили самолет в срок, получив благодарность от командования.

К сентябрю 1944г. обеспечил 107 боевых самолетовылетов. Приказом от 12 сентября 1944г. старший сержант Полкуйко награжден медалью «За боевые заслуги».

Награжден медалью «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг.».

В честь 40-летия Победы награждена орденом Отечественной войны II степени.