К началу войны служил в составе 94 скоростного бомбардировочного авиаполка Киевского особого военного округа.

22 июня 1941г. в 18-40 первая девятка самолетов СБ полка бомбардировала войска противника северо-восточнее Грубешув, вторая девятка- в районе Устилуг.

23 июня экипажи полка вновь бомбардировали войска противника, наступавшие на Владимир-Волынский, в районе Устилуг.

24 июня- боевые вылеты в районы Лешнев, Берестечко, Гуровицы, на дорогу Брест- Ковель.

25 июня- в район Ковеля.

26 июня- в районе Владимир-Волынский.

27 июня- на переправу через Буш в районе Сокаль.

28 июня- Подгайцы, Струмичи, Варковичи.

29 и 30 июня- Ровно-Дубно.

К средине июля полк вел боевую работу в районе Фастова.

Указом Президиума ВС СССР от 02 августа 1941г. сержант Заяц был награжден орденом Красного Знамени.

В начале июня 1942г. полк, личный состав которого переучился на самолеты Пе-2, дислоцировался на аэродроме Лантротовка. Вошел в состав формировавшейся 270 бомбардировочной авиадивизии.

Боевую работу вел на Волчанском и Купянском направлениях.

14 июня при выполнении задания, огнем противника была перебита гидросистема самолета №15/71 экипажа: капитан Бондарев Николай Андреевич, штурман лейтенант Оридорога Владимир Степанович, стрелок-радист сержант Заяц. Летчик совершил вынужденную посадку на фюзеляж. Экипаж невредим.

27 июня с разведывательного вылета не возвратился экипаж самолета №6/35: летчик лейтенант Васильев, штурман лейтенант Иванников Федор Данилович, стрелок-радист сержант Заяц.

Николай Васильевич был ранен. До 15 сентября 1942г. находился на излечении в эвакогоспитале ЭГ 360.