На фронте с 06 августа по 14 октября 1941г.

В мае 1942г. в составе 4 дальнего разведывательного авиационного полка (командир- майор Берман Семен Давидович, военком- батальонный комиссар Артемьев Борис Павлович).

Авиамоторист старший сержант Ботышев к средине феврался 1943г. подготовил самолеты к 45 боевым вылетам, без случаев отказа материальной части по его вине. 

Приказом от 16 февраля 1943г. был награжден медалью «За боевые заслуги».

В январе 1943г. командование полком принял подполковник Артемьев Борис Павлович.

В июне 1943г. полк был преобразован в 98 отдельный гвардейский разведывательный авиаполк. 

05 октября 1944г. командиром полка был назначен гвардии подполковник Звонцов Федор Федорович.

За годы войны механик авиационный гвардии старшина Ботышев подготовил самолеты Пе-2 к 173 боевым вылетам.

Приказом от 01 мая 1945г. был награжден второй медалью «За боевые заслуги».

Награжден медалью «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг.».